Jeżeli chodzi o oprogramowanie zenon, które oferuje COPA-DATA, to występuje ono m.in. w wersji zenon Pharma Edition, które zawiera szereg funkcji przeznaczonych właśnie dla branży farmaceutycznej. Takimi są na przykład zbieranie i przetwarzanie danych zgodnie z międzynarodowymi standardami, ścieżki audytu, zarządzanie użytkownikami i alarmami oraz zapewnianie zgodności z wytycznymi GMP kategorii 4 dla przemysłu farmaceutycznego.
Na polskiej liście referencyjnej COPA-DATA znajdują się w przypadku branży farmaceutycznej m.in. firmy ICN Polfa Rzeszów, GlaxoSmithKline, Teva Pharmaceuticals, Hasco-Lek, US Pharmacia, Grupa Adamed oraz Grupa Polpharma.